Ca n´a rien à voir. L´option "pas d´ennemie" consiste à mettre ou non des ennemies en free-ride (à utiliser quand le mode histoire est fini). Donc ton problème est plutôt lié à un bug qu´à une option. Pour le résoudre il te faut relanser une partie coop.
Il est possible que je me trompe, mais je n´ai jamais jouer avec les énnemies en mode free-ride et quand je devais éliminer des boss via le coop je n´ai pas eu ce problème.