Je suis pas sûr d´avoir bien compris.
En gros, tu demande si les roms+sauvegardes de ta DS sont transférées sur ton pc, puis après formatage de ta DS, tu les remets sur ta DS, est-ce que les sauvegardes fonctionneront ?
Si c´est bien ça, les sauvegardes fonctionneront toujours. Il n´y a aucune raison pour qu´elles ne fonctionnent plus.