En fait lorsqu´une mise à jour de mod est effectuée, tu as les modifs dans le readme qui l´accompagneavec si possible les dangers de tel ou tel changement.
Sinon le pire qu´il peut t´arriver c´est de te retrouver avec des erreures de chargements de ta save car elle aura en mémoire des variables concernant les anciens mods. Généralement si tu as désinstallé le mod OU mis la mise à jour il ne devrai pas y avoir de problème à réenregistrer sur ta save. Le pire c´est de perdre quelques objets ou autres que le mod à retiré.
fais bien attention sur certains mods qui te permettent de faire des trucs ( maisons, mannequins, etc...) qui une fois enlevé disparaisse avec tout ce que tu y avais mis...