* Mémoires d'un fou, 1838
* Madame Bovary, 1857 et 1930 (éd. suivie des actes du procès)
* Salammbô, 1862 et 1874 (éd. définitive)
* L'Éducation sentimentale, 1869
* Le Candidat (vaudeville), 1874
* La Tentation de saint Antoine, 1874 et 1903 (éd. définitive)
* Trois Contes :Un cœur simple, La Légende de saint Julien l'Hospitalier, Hérodias, 1877
* Le Château des cœurs (théâtre), 1880
* Bouvard et Pécuchet (inachevé), 1881
* Par les champs et les grèves (Voyage en Bretagne), 1886
* Mémoires d'un fou, 1901
* À bord de la Cange, 1904
* Œuvres de jeunesse inédites, 1910
* Dictionnaire des idées reçues, 1913
* Premières œuvres, 4 vol., 1914-20
* Novembre, 1928 (mais 1842)
* Souvenirs, notes et pensées intimes (1838-1841), 1965
* Album, annoté par Jean Bruneau et Jean A. Ducourneau, 1972
* Bibliomanie et autres textes 1836-1839, 1982