J'ai un très bon schéma de partitionnement, qui je pense est le plus propre que j'ai jamais trouvé ! 
Le voici :
"/" et swap séparés : Nous avons donc deux partitions, dont une ( "/" ) contient le système + les données personnelles ( "home").
Par après, je crée une troisième partition que je nomme DATA ( D: ou une autre lettre, peu importe ! ).
Puis, quand je suis dans ma distribution, je vais dans le fichier "home" via le gestionnaire de fichiers ( ex : Nautilus ou Konqueror ) et je crée un LIEN ( "raccourcis" est aussi un terme très utilisé ) vers ma partition DATA. ( Clic droit, "créer un lien" normalement...
Alors, pourquoi ne pas avoir directement dit : "/, /home et swap séparés" ?
Tout simplement parce que ma partition de données personnelles ne s'appelle pas DATA, et que je peux aussi l'utiliser en dual boot, ... et que j'ai créé un fichier lien dans le système au cas où j'aurais de gros problèmes avec mes partitions.
Donc, oui, je conseille 3 partitions : "/", "/home" et "swap". Par après, tu peux en rajouter, tu peux supprimer le système sans perdre tes données.
Tout séparer n'est pas une solution propre, et restreint parfois la mémoire.
Ça, c'était ma méthode et mon avis sur celle-ci, je sais pas ce que vous en pensez, mais ça marche très bien chez moi ! 