J´aimerais bien pouvoir répondre à ta question, mais je n´ai jamais fait cette experience...
Je suis de toute façon dans le même cas que toi, j´utilise les deux types de cartes mémoires.
Maintenant, et ce n´est qu´une supposition, si tu dois avoir un probleme pendant une partie, je pense que c´est la carte mémoire sur laquelle tu es en train d´enregistrer que tu auras un probleme ( généralement, le port A...)
Mais bon, fais le test, et dis nous comment ça s´est passé... MDR.