Pour répondre à la question et parler en termes "techniques" (oui, on ne me change pas ;) ), l´évolution des affinités entre Cloud et Aeris, Cloud et Tifa, Cloud et Yuffie, Cloud et Barret dépend des choix que fait le joueur durant sa partie (cf. topic "flirt au gold saucer").
Mais, les scénaristes ont quand même mis un avantage conséquent sur Aeris (c´est de loin la personne avec laquelle Cloud a le plus de chances de sortir au Gold Saucer). Donc même si tous les scénarios sont possibles, techniquement parlant, Cloud va pencher plus naturellement pour Aeris. Ce qui va expliquer d´ailleurs le comportement de Cloud dans Advent Children.
Les RPG permettent souvent d´influer sur des éléments du scénario, parce que c´est le type de jeu qui veut ça et c´est beaucoup plus marrant ainsi. Mais en l´occurrence il y a quand même une inclinaison naturelle du jeu pour rapprocher Cloud à Aeris.