Nibelheim a effectivement brûlé 
Après l´incendie, Zanghan et tous les amis de Cloud ont également péri, sauf Tifa et la Shinra a lancé une importante opération secrète visant à reconstruire le village à l´identique de ce qu´il était avant l´incendie. Une fois les travaux terminés, elle a subventionné des civils (ou bien des repris de justice...) pour qu´ils se réfugient et passent leur vie à Nibelheim pour entretenir le mensonge qui plane sur cette ville...
En fait, la Shinra n´a jamais interrompu les fuites de Mako au réacteur de Nibel pour que les monstres puissent continuer d´errer sans problème dans la nature, afin d´effrayer les gens et qu´ils ne s´aventurent pas dans la région Nibelheim de façon à permettre aux équipes de Shinra de reconstruire la ville dans la plus grande discrétion...