parfois ce genre de "bug" est du au changement de touches.
perso, je els changent toujours, et dans ce jeu, a de nombreux moments de l'aventure, j'ai du mettre pendant un instant la config de base, pour pouvoir actionner, declencher, ou reagir correctement dans une certaine situation.
ex de mémoire: les mini jeux, les chocobos, certains dialogues avec choix d'equipe, des actions speciales (je dis au pif pour donner un ex = distributeur shinra, taper dessus avec O , mais fonctionne pas si on a mis X a la place ...), ou encore pour le code de la fusée, etc...
bref rien de genant, faut juste penser a ca, et en cas de reaction bizare du jeu, quand on epsne avoir fait ce qu'il fallait faire, tester avec la config normale.
maintenant rien ne dis que ton probleme vient de la, mais on sait jamais, si tu as changé de config, cela peut valoir le coup de tester.