ben ça dépend de ce que tu veux comme résultat.
en tradi tout est possible, generalement on utilise de l´ecoline, une encre de couleur, mais ça peut être ce que tu veux.
en logiciel, photoshop, gimp, voire painter pour certains. de toute façon, si tu compte faire un mise en couleur numérique, il te faudra une tablette graphique. (ou une infini patience a la souris^^) 