La commande "jar" est disponible avec le jdk (dans le dossier bin).
Il faut faire quelque chose comme:
jar -cf nomFuturJar.jar .
(Le "." est le dossier qui sera dans l'archive, c'est-à-dire le dossier courant dans cet exemple.
Les ".jar", ".war"... sont des ".zip" dont les noms d'extensions sont différents pour représenter leurs utilités.