Windows ?
Avec XP, il suffit de mettre un mots de passe sur toute les sessions, puis de lancer le logiciel normallement puis fermer la session (juste la changer en fait, sans la fermer).
Le logiciel continu de tourner en arrière plan et on ne peut pas acceder à ton ordi sans utiliser le mot de passe d´ouverture de session.
Fondamentalement sa doit marcher aussi sous 2000, mais on ne peut pas "changer" de session, donc ça doit être moins évident (il doit falloir faire tourner le programme en tant que service ou dans un compte admin ou un truc come ça).