ça dépend de quoi tu parle.
le java n´est pas un truc de modélisation.
théoriquement je pense qu´on doit pouvoir faire de la 3D en java ( en javascript aussi mais c´est encore plus théorique, enfin je ne suis pas sur que ce soit techniquement réalisable).
mais bon, je ne comprend pas ta question, tu veux un logiceil pour faire des animation ou un langage pour les manipulé ?