Le plus rapide : niveau 50 est suffisant pour se faire Lavos (quoi que sans les équipements...)
M'enfin bref, le temps de finir les quêtes secondaires, t'auras largement le niveau pour l'éclater sans soucis.
Ensuite, dans l'ordre :
Avant de courser le monstre, est-ce que t'as bien utilisé le sable doré en préhistoire ? Si oui, tout au fond de la forêt (nord ouest si j'me plante pas), il y a une grande souche d'arbre fraîchement coupée. Peut-être as-tu raté un combat nécessaire pour déclencher le script, ou n'a pas marché où il fallait (ouais, c'est mal foutu ce donjon bonus -_-). Bref, essaye de bien ratisser la carte, en prenant tous les chemins possibles, etc.
Ensuite, pour le "sage de la foire", oui, c'est bien lui. Tu peux récupérer un clone de Chrono en jouant à un jeu. Si tu avais déjà gagné le clone, il est dans la maison de Chrono.
Pour les quêtes secondaires, http://www.lafindestemps.net/chrono-trigger-faq.html#30 . Parle à tes personnages "en attente" à la fin des temps pour avoir une indication du lieu ou aller.