Clairement, migrer de stable vers testing ça peut parfois provoquer de la casse sur les usines à gaz comme Gnome ou KDE.
Après, pour Xorg faut voir... ça m'étonne un peu cette histoire. Récemment j'ai installé Jessie via les deux méthodes, et dans les deux cas j'avais un Xorg qui fonctionnait au bout du compte. (bonus: en unstable ça fonctionne encore)
Mais je n'utilise qu'un gestionnaire de fenêtres avec ça, aussi.
Sinon pour avoir le dernier Gnome, soit on passe sur une branche supérieure de Debian, soit on fait de l'apt-pinning, soit on joue au plus malin et on essaie de tout compiler soi-même (pour se rendre finalement compte que c'est pas pour rien que des bénévoles créent des packages
).