A priori non, tu ne risques rien niveau sécurité, t'auras juste un Fedora avec des programmes de base qui ne vont sans doute pas trop te servir
(je peux me tromper, peut-être que tu les utilises !)
Et pour la deuxième question, par changement de version tu entends Fedora 17 ou un autre spin de Fedora ?
Si tu fais l'upgrade F16 -> F17, je pense que tu garderas tous ces outils, oui.