Parce qu'un logiciel qui n'est pas dans les dépôts n'a pas été testé par les mainteneurs du système, et a donc des chances d'être buggé, et de présenter des problèmes de compatibilité avec le reste de ton OS.
Par ailleurs, si ça n'est pas dans les dépôts, c'est probablement trop amateur pour être utilisé sérieusement (à grande échelle).
(à part ça, tu peux vraiment pas faire attention à écrire des phrases qui ont du sens, grammaticalement parlant ?)