Tu peux faire plein de liens symboliques, mais c'est moche et si tu changes quelque chose sous Windows faudra que tu le rajoutes à la main dans ton dossier...
Ou alors, tu peux faire un script qui se lance à chaque démarrage, qui met à jour automatiquement ta liste de liens symboliques, mais faudra faire gaffe à ce que ta partoche Windows soit montée avant l'exécution du script, et c'est de toute façon une solution assez monstrueuse.
Quand à savoir si Gnome permet ça, ben... Regarde dans le gestionnaire de Config, si ça y est pas c'est probablement que tu peux pas le faire
(Ou alors change d'environnement de bureau, parce que t'as pas fini de te poser des questions bizarres avec Gnome)