oui effectivement (c'est mieux de mettre les choses au clair).
Néanmoins j'ai avancé un peu depuis tout a l'heure.
J'ai réinitialiser le mot de passe root (de mysql) via phpmyadmin.
La connexion en root marche depuis phpmyadmin.
Et mieux : quand je fais dans mon terminal "mysql -p" et que je rentre mon mdp, et bien ca marche, j'obtiens l'invite de commande "mysql>".
Du coup le problème n'existe plus que dans la connexion à la bdd...
Depuis mon site je recois : "Connection failed: SQLSTATE[HY000] [2003] Can't connect to MySQL server on ..." (le mot de passe quoi qu'il arrive n'a pas changer c'est sur, d'autant que je me connecte à cette base de donnée depuis un utilisateur autre que root (avec lequel je pouvais toujours me connecter depuis phpmyadmin sans soucis)
Ce que je trouve bizarre c'est que quand je fais un nmap sur 3306 depuis un autre ordi sur mon serveur, j'ai un port avec state "closed" 