Exemples :
- http://serveur.deblan.fr/ (le données sont tirées de commandes passées dans un shell_exec(), system() de php)
- sur mon serveur web, j'ai un script écrit en php qui reboot apache2 si certaines conditions sont remplies (je pourrais le faire en bash, mais je suis plus à l'aise avec php). Pour le reboot, c'est avec shell_exec().
- je génère des stats avec php et des commandes linux dans un shell_exec()
Il y a encore bien d'autres exemples 