Hum et c'est un serveur pour faire quoi plus précisément ?
Applicatif ? Serveur FTP ? Web ? Firewall ?
Un serveur peut faire pas mal de choses, pour le Web par exemple, les serveurs Linux ont tendance à utiliser Apache (combiné parfois avec Tomcat), là ou sous Windows Server on a tendance à préférer IIS.
Pour l'applicatif faut faire gaffe car certains logiciels pros ne tournent que sous Windows Server et d'autres uniquement sur des Unix.
Sinon j'ai pas de tableau sous la main mais n'oublie pas que la comparaison de coût est assez complexe. Faut compter les machines, les prix des OS, des licences, des éventuels supports, de formation des techniciens par exemple. Pour le Web t'as la durée moyenne d'uptime (et là je lance un bon troll, l'uptime d'IIS est bien naze comparée à un bon Apache bien configuré).