Gentoo, c'est surtout intéressant pour apprendre le système Linux, pour bidouiller, trouver les fichiers de config, etc...
Je trouve pas que Gentoo soit beaucoup plus "customizable" qu'une autre distribution. En fin de compte, c'est le gestionnaire de fenêtre qui déterminera à quoi ressemblera ton bureau.
Comme l'a dit Dragor, essaie différents gestionnaires: XFCE, KDE, Fluxbox, IceWM, WindowMaker, ... et si t'es toujours pas satisfait, développe ton propre gestionnaire ;-)