Oui on peut, du moins depusi Linux on peux bidouiller les fichiers Windows avec ntfs-3g.
Le truvc c´est que je suis sur le PC familliale, et que mon frere et mes parents, si depuis Linux y accedent a Windows, et qui voient un fichier desktop.ini, ou boot.ini, "bah tiens qu´est-ce que ca fou la ? Allez hop, supprimer !" . Et le probleme c´est que ces fichier, depuis linux, on les voit très bien ^^. Fallait donc que je désactive l´écriture sur NTFS, la partition FAT32 me sers de tampon entre les deux OS... Complexe mais évite un drame.