(Question bête mais on sait jamais...)
T´utilises bien la dernière version de Ubuntu (7.04)?
Je suppose que tu as téléchargé le paquet ntfs-config. Ca devrait marcher certes...
Quand tu tapes la commande "mount" avec ton DD branché, ca renvoie quoi?
Au pire, essaye de faire "chmod +w -R /chemin/du/disque" pour rajouter le droit d´écriture en récursif sur ton DD pitêtre que ca marche.
Sinon un petit formatage en FAT32 ? 