Vu que tu dois être nouveau avec vim, je vais décortiquer le gg=G.
g.
goto
Ici, on utilise le cas spécial gg qui permet de remonter au début du fichier.
=.
indente automatique la zone couverte par .
G
va à la fin du fichier
Donc =G
indente jusque à la fin du fichier.
Et donc : gg=G
indente tout le fichier.