Je mettrais Suse est windows sur chacun des disques dur.
Windows sur le disque maitre (parce que sinon il ne s´installe pas)
suse sur le disque esclave, et une partition FAT32 sur le disque maitre (celui de windows) pour pouvoir échanger des fichiers entre chacun des deux systeme, car les partitions FAT ont l´avantage d´etre accéssible en lecture et en écriture, aussi bien sous linux que sous windows
Pour ton partitionnement de suse, je ferais comme sa moi:
10 Go la partition racine /
1 Go la swap (le mieux est que sa fasse la taille de ta ram)
Le reste pour une partition /home qui contiens toutes des données personnelles, comme sa, si tu réinstalle ton systeme, tu formate seulement la racine, tu garde ton /home, et tu pourra ainsi garder tes données personnelles 