C´est pas un émulateur (il n´emule pas une architecture), mais un interpréteur, il interpréter les instruction de programmes windows pour pouvoir les executer a partir de librairies écrite par les développeurs de wine.
Donc avoir une copie conforme de win32 API, mais libre 
Si il en arrivent la, ont pourraient surement executer 100% des programmes windows mais ont en est loin pour le moment
Mais wine permet tout de meme d´executer pas mal d´applications et de logiciels en 3D se basant sur openGL.
Pour les applications DirectX (certains jeux par exemple), il faut utiliser cedega (anciennement wineX) qui se base sur wine et y ajoute l´implémentation de DirectX, et permet ainsi d´executer les logiciels directX (pas mal de jeux windows tourne sous linux grace a ce systeme)
Mais la encore il reste du progres a faire pour que windows ne serve plus du tout a rien
Et l´arrivée de windows vista risque de ne pas améliorer les choses 