Linux était installé sur un 2ème DD donc ?
et le DD de ta mère est le 1er ?
Dans ce cas, le loader est placé sur le secteur de démarrage du premier DD (sur le mbr) : même si tu enlève le 2ème disque le loader est toujours là.
Ca n´est pas dans windows : le boot.ini n´est pas concerné, en fait windows ne "sait" même pas qu´un autre OS est là.
Si tu supprimes Linux du menu de démarrage il y aura toujours le loader, mais il ne proposera que windows.
une solution serait de réduire au maximum le temps d´attente avant lancement de l´os par défaut, et de faire de windows l´os par défaut.
il doit y avoir une autre solution, mais je ne connais pas... 