pour le / boot je te conseil le ext2 , c´est ext3 pas journalisé tu es sur de ne jamais avoir de problème.
Et oui c´est mieux d´en avoir une de partition boot qui n´est pas monté par défaut donc moins beaucoup de problèmes....
pour la différence j´avais expliqué ça dans le thread problème d´installation mais bon copier coller -->
la différence est au niveau de l´algorithme qui gère ton fs donc, celui-ci aura des caractéristiques différentes par exemple xfs va très bien pour les gros fichier mais perd du temps et de la place pour les tout petit fichier, reiserfs est génial pour gérer des arbres avec plein de sous-dossiers, contenant des petits fichiers, et ext3 est le fs de base de linux qui d´après les benchmark est celui qui s´en sort le mieux en général en plus il très stable.
Autres choses à regarder sont les outils de réparation du fs pour ça reiserfs et xfs sont beaucoup mieux équipé que ext3 et jfs(IBM)...
Donc en résumé c´est surtout une question de gout et de choix
j´espère que ça répond à vos questions 