wine est tout bordelique. Normalement la configuration se fait en 3 étapes :
- lancer l´appli dans le vide une première fois qui te crée les reps, le . conf et tripoter à la main le . conf pour tout vérifier
- inclure une base initiale pour simuler le comportement de la base de registre "minimum" ( c´est decrit sur leur site, mais je sais plus où, ils donnent au même endroit un script pour tester wine + le fichier à insérer avec la méthode)
- parametrer spécifiquement certaine applis + récuperer certaines dll ( eventuellement), pour te guider, il faut aller sur http://appdb.winehq.org/ puis browse apps et chercher celle que tu veux faire tourner.
mais bon, de mon expérience : bonne chance !