Il n'a aucun lien avec la Team Yondaime, ne la surement pas connu et personne d'extérieur ne pourrait deviner qu'il s'agissait d'Obito en particulier, qu'il en pince pour Rin et qu'il tient Kakashi pour responsable.
Soyons logique et lucide, comment Kabuto pouvait le deviner alors qu'il était totalement extérieur a cette guerre ? Je suis même pas sur qu'Orochimaru aurait pu le guider dans cette voie, d'autant que Tobi s'est présenté biiiiien après le départ d'Oro de l'Akatsuki.
Dans ton esprit il était facile de deviner que Tobi = Obito parce que nous file des infos tout le long du Manga, pour Kabuto et le peu d'information et de lien dont il dispose avec Tobi, c'est quasiment impossible, même pour un mec qui courre après la moindre info.