En général, lorsqu´il y a séparation des pouvoirs, les pouvoirs législatif, exécutif et judiciaire sont confiés chacun à un organe; mais avec l´UE c´est pas vraiment le cas, d´où l´intérêt de la question...
On n´a pas encore vraient étudié la question, mais du Parlement, de la Commission, du Conseil de l´Union (des ministres) et du Conseil européen (plus un organe qu´une institution comme ces trois dernières), seul le Conseil européen ne participe pas en fait au povoir législatif si je ne me trompe...
Y´a plusieurs procédures possibles, en fonction de la matière...
Bref, c´est plutôt complexe a priori...