Quand on scelle un bijuu il ne revient plus (comme Shukaku et Gyuuki qui étaient enfermés dans des pots).
Ils ne reviennent après la mort que car le chakra est toujours présent dans le monde ordinaire, et que (si j'ai bien compris) il se regroupe petit à petit jusqu'à reformer le bijuu.
Et puis Minato a d'abord scellé la moitié de Kurama en lui, puis le Shinigami a pris l'âme de Minato (avec Kyuubi à l'intérieur), c'est pour ça que leurs deux âmes n'en forment qu'une seule quand ils sont scellés 