Je pense surtout que le problème de Kakashi est sa faible quantité de chakra, ajouté à cela l'utilisation inconsciente/intuitif du sharingan. Dès que le sharingan voit quelque chose, il l'analyse, et du coup consomme du chakra, ce qui ne semble pas être le cas du rinnegan.
Quant à Danzo, le problème est que la greffe d'Hashirama a prit le dessus sur lui, ce qui peut s'expliquer par l'incroyable vitalité de son ADN qui lutte contre l'organisme étranger, comme la greffe d'Oro sur Kabuto.
Et pour Yamato, ça ne le fait pas, soit parce que la greffe est plus minime, soit comme elle a était faite quand il était gamin le corps s'est adapté naturellement.