Graphics Gale est pas un des meilleurs programme pour la transparence mais bon, essaye de faire :
Image -> Add Alpha Channel
Sélectionne a l'aide de la baguette magique ou lasso, ou rectangle ce que tu veut transparent et tu fait supprimer, ca va devenir blanc et c'est ca la transparence, sinon en haut complètement a droite (l'icone du crayon) tu peut le mettre sur l'efface pour effacer qui revien au même que supprimer
ensuite au moment de sauvegarder tu sauvegarde en .png et tu coche la case With Alpha Channel
sinon si tu veut pas te casser la tête avec la transparence de graphics gale le mieux est d'utiliser un ColorKey exemple (R:255,G:0,B:255) le plus utiliser pour une couleur transparente (Je connais pas trop python et pygame mais d'après la doc tu fait)
colorkey = (R, G, B)
Surface.set_colorkey(colorkey)