Alors, les herbes et les buissons et les branchages (ou brindilles) repoussent si tu ne les enlève pas à la pelle.
Le reste ne repope pas (les carottes, les arbres, les rochers, les ruches, etc). Tu peux en récupérer en fabriquant des fermes pour les carottes (en sachant que tu peux quand même en avoir en quantité illimitée si tu attrapes un oiseau et que tu le mets en cage: à ce moment là, si tu lui donnes des légumes à manger, il va te fournir des graines spécifiques pour ces légumes), en replantant des pommes de pin pour les arbres ou des glands pour les autres types d'arbres.
A priori, mettre un sol ou un autre avant de replanter ne change rien (peut-être éventuellement une pousse plus rapide mais j'en doute).
Pour les buffles, je ne sais pas si mettre un sol savane peut favoriser leur sédentarisme. Le mieux pour t'assurer qu'ils restent dans le coin, bah, c'est de les enfermer, en laissant juste un espace pour que tu puisses passer (eux ne pourront pas sortir).
Pour les roches, en général, il y en a pas mal sur la map. Si toutefois, tu épuises ces ressources, sache que dans les cavernes, il y en a en masse. C'est le meilleur endroit pour t'approvisionner en grosses quantités