Faudrait déjà que ce soit sur un serveur Windows, il me semble qu'il n'y a pas de base de registre sous linux...
Si tu as un dédié tu peux exécuter du shell Windows, et manipuler regedit en ligne de commandes, ou via shell_exec en PHP ou fonction équivalente dans un autre langage serveur.
Si tu es sur un mutu je pense pas que tu auras les droits nécessaires, et même un dédié je suis pas certain que tu puisses modifier comme ça la base de registre. 