J'avoue ne m'être jamais posé la question, PhpMyAdmin ne me sert à rien : je code en PHP, j'utilise donc les outils disponibles, je contrôle mes flux de données, c'est tout.
PhpMyAdmin me simplifie juste la vie quand je veux supprimer certaines entrées ponctuellement, ou quand je veux créer/importer/exporter une ou plusieurs table(s), le reste, heu...
Mais sinon, en quoi est-ce gênant, au juste ?
Ça s'affiche mal dans PhpMyAdmin, d'accord, mais tant que lors du traitement de tes entrées tout va pour le mieux, je ne suis pas sûr que ça vaille le coup de chercher 