Il y a autant de failles sous linux que sous Windows, OSX ou n´importe quel OS.
C´est vrai que Windows est la principale cible des pirates, qui de fait, s´attaquent à ses failles.
Mais, comme la plupart des serveurs tournent sous Linux, ils sont constamment la cible de pirates, qui découvrent les failles et les exploitent.
L´avantage d´un OS OpenSource comme Linux, est d´avoir une communauté énorme de développeurs potentiels capables de corriger rapidement une faille quelconque (et parfois, en créer d´autres, mais bon).