Oui, il y a des différences entre les versions Wii et Wii U de Just Dance 4. La Wii U possède en plus un « mode marionette » : il s'agit d'un mode de jeu à part dans lequel sont disponibles 11 chansons du jeu. La personne qui utilise le Wii U GamePad peut choisir sur l'écran tactile le prochain mouvement qu'auront à effectuer les autres joueurs, entre autres.
D'autre part, 7 dance Mash-Ups sont uniquement disponibles sur les versions Wii U et PS3 (So What, Tribal Dance, Maneater, Wild Wild West par exemple).
Enfin, la qualité de l'image sera meilleure avec la version Wii U si tu joues sur un téléviseur HD.