J'ai jamais eu ce genre de problème.
Dans le doute, essaie de te connecter avec un compte Uplay (j'ai eu le platine sans Bug de trophée).
Mais la solution la plus radical reste de refaire l'histoire comme le dit Slax.
En revanche, je tient a nuancé car j'ai eu un crash de ma première ps3 et que je n'ai pas récupéré l'intégralité de mes trophées, j'en avais perdu pour plus de 100 points environ (mais j'ai bien eu le reste des trophées en ligne).