La transformation concerne plus probablement des changements "radicaux", comme l´électricité pour Kirua, le "pansy gum" d´Hisoka ou les fils de Machi.
Surtout, changer l´aura en boule ne revient pas à changer ses propriétés mais simplement sa forme. Pour Machi, par exemple, il n´est pas forcément évident de savoir si les propriétés de son aura changent, mais pour Hisoka et Kirua, il est clair que le nen devient "autre chose". A base de nen certes, mais "autre chose" quand même.
La principale différence réside dans ce point, et donc dans les définitions des types de nen; d´un côté on transforme réellement le nen en un autre élément plus ou moins concret, de l´autre on émet simplement. On peut citer Zéno Zoldik; de ce qu´on a pu en voir (attaque du dragon), il émet. Son aura change de forme, mais pas de propriétés...donc, émission (même si ça n´est peut-être pas son type initial, je ne sais plus vraiment).
Rien n´empêchant probablement de croiser les deux types, on sait qu´avec de l´entraînement on peut s´améliorer dans d´autres domaines que le sien. 