Le jour de la promesse, en 1999, deux groupes vont s´affronter pour disputer le sort de la Terre: les 7 Sceaux qui veulent préserver l´espèce humaine, et les 7 Anges qui voient en l´annihilation de l´Homme le salut de la planète. Enfin ça c´est pas dit explicitement, on le découvre au fur et à mesure.
Tout se passe autour de Kamui Shiro, lorsqu´il revient à Tokyo. Selon les dires, c´est de lui que dépend le sort de la planète. Deviendra-t-il le leader des Sceaux ? Ou bien des Anges ?