Pas du tout.
L'histoire est telle que tu la construis au fil du jeu. Si tu tues tout le monde, la fin sera plus sombre, c'est tout. Si tu joues infiltration, c'est toi qui décides de te limiter.
(Perso, ma première partie s'est jouée en mode "ça passe ou ça casse", et s'est soldée sur plusieurs centaines de cadavres. Ben j'ai pas l'impression d'avoir raté l'histoire.)