Je trouvais ça bizarre aussi.
Je pense que c'est par rapport à la perception de John de ces moments.
Si on fait attention, on voit que les moments observés à la première personne sont forts en intensité : quand il va subir une opération dont il n'est pas sûr d'en sortir, quand il se réveille et découvre son corps meurtri et mutilé, quand il s'apprête à aller combattre...
Mais plus simplement, on peut dire que le changement de vue se fait pour le spectateur, pour qu'il perçoive mieux les choses comme le réalisateur le voulait. 
Et cette hypothèse est plus proche de la réalité, je pense.