Il y a des trucs bizarres car Iron Man utilise des armes à feu en tous genre pourtant il est moins "dark". 
Le traitement n'est pas le même. La violence d'un Iron Man est plus régressive, banalisée comme dans un cartoon par exemple. Il y a des morts mais le traitement n'est pas le même, il n'y a rien de choquant à le voir tuer. Le mec se rapproche plus d'un "soldat" que d'un "justicier", il combat le terrorisme, les aliens, ect. C'est con à dire mais les victimes qu'il fait, on s'en branle vu que c'est des "méchants" déshumanisés.
Si on est choqué dans Batman v Superman de voir Batman tuer, c'est car le contexte est différent. Batman combat des criminels donc des gens pas forcément mauvais : les hommes de mains de Luthor qu'il butte sont des mercenaires qui ne font surement que ça pour de l'argent, les mecs ne sont pas "mauvais" comme les terroristes ou aliens que Iron Man combat.
En plus de ça Iron Man est un "soldat" il n'y a rien de choquant à ce qu'il tue, Batman est un "justicier" et ça règle d'or normalement est de ne pas tuer, voila pourquoi c'est choquant.
Le traitement de la violence y est pour beaucoup aussi, voir Iron man buter des gens tranquillement (à la manière d'un Luke tuant des Stormtroopers, ou d'un Mcclane tuant des terroristes, ou de n'importe qu'elle héros de film d'action pop-corn) ne nous affecte point, évidemment les personnes qui tue sont tuer proprement, comme souvent on le leur montre pas leurs visages (ou du moins un visage sympathique).
Dans BvS quand Batman bute il le fait froidement, violemment, voila pourquoi c'est dérangeant.
Le problème ce n'est pas forcément de voir Batman buter des gens c'est dans la manière dont c'est fait : un Iron Man ne nous choque pas car la réalisation banalise la violence, la rend cartoonesque (voila pourquoi personne gueule quand Batman tue dans les Burton). Dans BvS, la réalisation nous montre un Batman ultra violent (donc ne banalise pas la violence) sans la remettre en question. Ca donne un coté dérangeant à la chose.
Batman qui bute ? pourquoi pas. Mais il faut le faire bien, remettre ces actes en question (Alfred par exemple pourrait le faire), appuyer plus en détail sur le fait que Batman est pas tout rose. Le film sur ce point (comme sur bien d'autres) a le cul entre 2 chaises ce qui rend la violence de Batman presque dérangeante.