Salut 
Ils font des très bons logiciels de Musique, chez Myriad : http://www.myriad-online.com/fr/
Pour faire des versions numériques des partitions que j'écris, je me sers déjà de leur Melody Assistant (Qui, malgré son nom, ne donne pas d'idée mais permet plutôt de les mettre en forme.). La version gratuite a quelques fonctionnalités bloquées, mais elle offre quand même énormément de possibilités (Et même quand c'est bloqué, il y a moyen de faire autrement en utilisant des logiciels annexes.)... Comme la transposition 
Malheureusement, ce genre d'opérations ne peut s'effectuer que si on arrive à importer une partition depuis un scan au format pdf...
Je viens d'aller faire un tour sur leur site, à nouveau, et j'ai trouvé PDFtoMusic... L'astuce, c'est de s'en servir pour importer un fichier pdf, puis d'en faire un fichier midi, fichier midi exploitable sous Melody Assistant... Je viens de faire un test, ça marche d'enfer
. Le seul inconvénient que j'ai trouvé (Certes en cinq minutes de test.), c'est que la version gratuite de PDFtoMusic ne permet d'exporter qu'une page à la fois... Enfin bon, tu n'as qu'à répéter la manoeuvre pour chaque page. Ah oui, sinon, Melody Assistant risque d'être un peu vicieux et de placer un gros "PLEASE USE REGISTERED VERSION" sur les fichiers pdf qu'il exporte, et qui n'apparaît qu'une fois sorti à l'imprimante. Tu n'auras qu'à refaire un export pdf, le message n'est pas placé systématiquement.
Voilà, tout ça gratuit - http://www.myriad-online.com/cgi-bin/download.pl?lang=FR -, mais rien ne t'empêche d'acheter les versions payantes !