Deux notes l´une sous l´autre ça s´appelle un Accord. A la flute tu ne peux en faire sachant que c´est un instrument monophonique, et donc qu´il ne peut produire qu´un son, au contraire des instrument polyphonique qui en produisent plusieurs en meme temps...
Donc oui tu dois avoir une partition de piano 
Pour faire simple, soit tu joue à deux, soit tu joue qu´une note sur deux, soit tu joue deux fois, en changeant les notes...