Tu confonds tout, les chunks, c'est les zones qui sont générées au fur et à mesure. 
Le problème que t'as eu, c'est une EUREUR de chunk, et pas un chunk tout court.
Et ces bugs sont très aléatoires, donc non, je crois pas qu'il y ai de mods ou de moyens spécials pour les éviter, du moins, pas à ma connaissance. 