Hmm, je saurais pas t'aider dans ce cas ! Le problème doit venir de ton Craftbukkit qui est certainement corrompu.
Lorsque j'ai rencontré ce problème j'ai :
-Sauvegardé tout mon FTP
-Tout virer (Plugins etc etc)
-Tout réinstaller un par un.
Puis ça a remarché, je n'avais plus de soucis avec mes plugins.
Cependant ! Si le soucis vient seulement de WorldEdit, tu dois pouvoir rétablir le problème.
Indice de recherche : Si c'est seulement WorldEdit qui bug sur ton serveur, c'est le plugin qui bug. Si jamais d'autres plugins buguent, c'est que le soucis vient de CB, la réinstallation est alors inévitable !